MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Geobacillus sp. WCH70 plasmid pWCH7002

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012790	AGG	2	6	115	120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239812974
2	NC_012790	ACA	2	6	134	139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239812974
3	NC_012790	TTGTG	2	10	148	157	0 %	60 %	40 %	0 %	239812974
4	NC_012790	GTT	2	6	178	183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239812974
5	NC_012790	T	8	8	200	207	0 %	100 %	0 %	0 %	239812974
6	NC_012790	A	7	7	213	219	100 %	0 %	0 %	0 %	239812974
7	NC_012790	A	6	6	335	340	100 %	0 %	0 %	0 %	239812975
8	NC_012790	TGT	2	6	361	366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239812975
9	NC_012790	TGT	2	6	376	381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239812975
10	NC_012790	AT	3	6	403	408	50 %	50 %	0 %	0 %	239812975
11	NC_012790	A	6	6	463	468	100 %	0 %	0 %	0 %	239812975
12	NC_012790	ATC	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239812975
13	NC_012790	GGA	2	6	518	523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239812975
14	NC_012790	GAT	3	9	543	551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812975
15	NC_012790	GTT	2	6	554	559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239812975
16	NC_012790	A	7	7	626	632	100 %	0 %	0 %	0 %	239812975
17	NC_012790	CAA	2	6	774	779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239812975
18	NC_012790	TTCAA	2	10	808	817	40 %	40 %	0 %	20 %	239812975
19	NC_012790	TA	3	6	940	945	50 %	50 %	0 %	0 %	239812976
20	NC_012790	A	6	6	956	961	100 %	0 %	0 %	0 %	239812976
21	NC_012790	T	6	6	968	973	0 %	100 %	0 %	0 %	239812976
22	NC_012790	GAAAAT	2	12	981	992	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	239812976
23	NC_012790	A	6	6	1006	1011	100 %	0 %	0 %	0 %	239812976
24	NC_012790	GCAAT	2	10	1060	1069	40 %	20 %	20 %	20 %	239812976
25	NC_012790	A	7	7	1205	1211	100 %	0 %	0 %	0 %	239812976
26	NC_012790	AGA	2	6	1214	1219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812976
27	NC_012790	A	6	6	1237	1242	100 %	0 %	0 %	0 %	239812976
28	NC_012790	ATT	2	6	1260	1265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812976
29	NC_012790	ATTTG	2	10	1285	1294	20 %	60 %	20 %	0 %	239812976
30	NC_012790	ATAC	2	8	1432	1439	50 %	25 %	0 %	25 %	239812976
31	NC_012790	GAA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812976
32	NC_012790	A	6	6	1557	1562	100 %	0 %	0 %	0 %	239812976
33	NC_012790	A	6	6	1585	1590	100 %	0 %	0 %	0 %	239812976
34	NC_012790	GGAAA	2	10	1594	1603	60 %	0 %	40 %	0 %	239812976
35	NC_012790	TTCCG	2	10	1610	1619	0 %	40 %	20 %	40 %	239812976
36	NC_012790	ATG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812976
37	NC_012790	CAG	2	6	1770	1775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239812976
38	NC_012790	AAG	2	6	1813	1818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812976
39	NC_012790	AAAAC	2	10	1878	1887	80 %	0 %	0 %	20 %	239812976
40	NC_012790	GAA	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812976
41	NC_012790	GA	3	6	2003	2008	50 %	0 %	50 %	0 %	239812976
42	NC_012790	GAA	2	6	2014	2019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812976
43	NC_012790	ACG	2	6	2036	2041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239812976
44	NC_012790	ACA	2	6	2054	2059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239812976
45	NC_012790	GAT	2	6	2073	2078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812976
46	NC_012790	TTAAA	2	10	2086	2095	60 %	40 %	0 %	0 %	239812976
47	NC_012790	TTA	2	6	2907	2912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812977
48	NC_012790	T	6	6	2930	2935	0 %	100 %	0 %	0 %	239812977
49	NC_012790	AT	3	6	2982	2987	50 %	50 %	0 %	0 %	239812977
50	NC_012790	TAT	2	6	3067	3072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812977
51	NC_012790	AAG	2	6	3099	3104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812977
52	NC_012790	GAA	2	6	3122	3127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812977
53	NC_012790	TGA	2	6	3135	3140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812977
54	NC_012790	AGG	2	6	3142	3147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239812977
55	NC_012790	CAG	2	6	3171	3176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239812977
56	NC_012790	AGGC	2	8	3182	3189	25 %	0 %	50 %	25 %	239812977
57	NC_012790	GCT	2	6	3293	3298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812977
58	NC_012790	GGA	3	9	3349	3357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239812977
59	NC_012790	ATG	2	6	3405	3410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812977
60	NC_012790	A	6	6	3453	3458	100 %	0 %	0 %	0 %	239812977
61	NC_012790	ATT	2	6	3473	3478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812977
62	NC_012790	CAT	2	6	3605	3610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239812977
63	NC_012790	GA	3	6	3676	3681	50 %	0 %	50 %	0 %	239812977
64	NC_012790	GAA	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812977
65	NC_012790	CGT	2	6	3764	3769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812977
66	NC_012790	TAA	2	6	3778	3783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239812977
67	NC_012790	GAA	2	6	3866	3871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812977
68	NC_012790	TCC	2	6	3892	3897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239812977
69	NC_012790	CAA	2	6	3926	3931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239812977
70	NC_012790	CGGTTC	2	12	3951	3962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812977
71	NC_012790	AAAG	2	8	4120	4127	75 %	0 %	25 %	0 %	239812978
72	NC_012790	GATT	2	8	4160	4167	25 %	50 %	25 %	0 %	239812978
73	NC_012790	GAAA	2	8	4200	4207	75 %	0 %	25 %	0 %	239812978
74	NC_012790	GAA	2	6	4210	4215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812978
75	NC_012790	A	7	7	4214	4220	100 %	0 %	0 %	0 %	239812978
76	NC_012790	CGTT	2	8	4276	4283	0 %	50 %	25 %	25 %	239812978
77	NC_012790	ATT	2	6	4327	4332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812978
78	NC_012790	TGC	2	6	4353	4358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812978
79	NC_012790	GATT	2	8	4407	4414	25 %	50 %	25 %	0 %	239812978
80	NC_012790	ATT	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812978
81	NC_012790	A	6	6	4444	4449	100 %	0 %	0 %	0 %	239812978
82	NC_012790	CCT	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239812978
83	NC_012790	AGA	2	6	4572	4577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812978
84	NC_012790	ATT	2	6	4580	4585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812978
85	NC_012790	CGG	2	6	4619	4624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239812978
86	NC_012790	CTG	2	6	4700	4705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812978
87	NC_012790	GAT	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812978
88	NC_012790	GCT	2	6	4839	4844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812978
89	NC_012790	CTG	2	6	4874	4879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812978
90	NC_012790	TGC	2	6	5938	5943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812979
91	NC_012790	GAA	2	6	6017	6022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812979
92	NC_012790	GGA	2	6	6028	6033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239812979
93	NC_012790	ACG	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239812979
94	NC_012790	T	6	6	6132	6137	0 %	100 %	0 %	0 %	239812979
95	NC_012790	GAA	3	9	6149	6157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812979
96	NC_012790	ATT	2	6	7657	7662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812980
97	NC_012790	GCAGG	2	10	7669	7678	20 %	0 %	60 %	20 %	239812980
98	NC_012790	TAT	2	6	7687	7692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812980
99	NC_012790	A	7	7	7713	7719	100 %	0 %	0 %	0 %	239812980
100	NC_012790	TAAA	2	8	7721	7728	75 %	25 %	0 %	0 %	239812980
101	NC_012790	A	6	6	7745	7750	100 %	0 %	0 %	0 %	239812980
102	NC_012790	TAA	2	6	7769	7774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239812980
103	NC_012790	A	6	6	7804	7809	100 %	0 %	0 %	0 %	239812980
104	NC_012790	ATT	2	6	7849	7854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812980
105	NC_012790	TCC	2	6	7859	7864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239812980
106	NC_012790	ATT	2	6	7879	7884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812980
107	NC_012790	AAG	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812980
108	NC_012790	A	7	7	7935	7941	100 %	0 %	0 %	0 %	239812980
109	NC_012790	ATG	2	6	7955	7960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812980
110	NC_012790	TGCT	2	8	7994	8001	0 %	50 %	25 %	25 %	239812980
111	NC_012790	AGC	2	6	8009	8014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239812980
112	NC_012790	A	8	8	8041	8048	100 %	0 %	0 %	0 %	239812980
113	NC_012790	A	7	7	8080	8086	100 %	0 %	0 %	0 %	239812980
114	NC_012790	A	6	6	8098	8103	100 %	0 %	0 %	0 %	239812980
115	NC_012790	CG	3	6	8131	8136	0 %	0 %	50 %	50 %	239812980
116	NC_012790	TAA	2	6	8169	8174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239812980
117	NC_012790	GCGTG	2	10	8182	8191	0 %	20 %	60 %	20 %	239812980
118	NC_012790	TGA	2	6	8228	8233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812980
119	NC_012790	GAA	2	6	9130	9135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812981
120	NC_012790	TCAATT	2	12	9139	9150	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	239812981
121	NC_012790	GGT	2	6	9187	9192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239812981
122	NC_012790	GAC	2	6	9196	9201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239812981
123	NC_012790	A	6	6	9257	9262	100 %	0 %	0 %	0 %	239812981
124	NC_012790	GAA	2	6	9286	9291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812981
125	NC_012790	TGT	2	6	9296	9301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239812981
126	NC_012790	TGC	2	6	9309	9314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812981
127	NC_012790	TCG	2	6	9329	9334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812981
128	NC_012790	A	6	6	9446	9451	100 %	0 %	0 %	0 %	239812981
129	NC_012790	TGG	2	6	9488	9493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239812981
130	NC_012790	AAG	2	6	9710	9715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812982
131	NC_012790	TGA	2	6	9798	9803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812982
132	NC_012790	A	6	6	9869	9874	100 %	0 %	0 %	0 %	239812982
133	NC_012790	GCA	2	6	9892	9897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239812982
134	NC_012790	TGT	2	6	9903	9908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239812982
135	NC_012790	A	6	6	9938	9943	100 %	0 %	0 %	0 %	239812982
136	NC_012790	AGA	2	6	10023	10028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812982
137	NC_012790	A	6	6	10037	10042	100 %	0 %	0 %	0 %	239812982
138	NC_012790	GACA	2	8	10090	10097	50 %	0 %	25 %	25 %	239812982
139	NC_012790	ACA	2	6	10113	10118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239812982
140	NC_012790	GCT	2	6	10147	10152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812982
141	NC_012790	AGA	2	6	10158	10163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812982

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.